Aproximación completa del genoma del cáncer de mama basal

Resumen

El cáncer de mama basal (BLBC) comprende hasta el 15% de los cánceres de mama. El BLBC es caracterizado por la baja o ausencia de la expresión del receptor de estrógreno (ER), receptor de progesterona (PR), ausencia de amplificación del gen HER2 y por la expresión de las citoqueratinas basales (Cks): Cks 5, 6, 14 y/o 17, receptor del factor de crecimiento epidermal (EGFR) y/o C-Kit. BLBC constituye una entidad clínica distinta y presenta un pobre prognóstico clínico (Sørlie et al. 2001). El principal objetivo de este proyecto es el mapeamiento completo y comparativo de las alteraciones genómicas en BLBC asociado o no con mutaciones en el gen BRCA1. Asi también, explorar el rol de la via de señalización de BRCA1 en BLBC. Por esta razón, utilizamos un arreglo de captura del exoma completo de 2.1M en 9 muestras congeladas de mama obtenidas del Departamento de Patología del Centre Jean Perrin-Clermont Ferrand. Actualmente, hemos identificado en un individuo (MCD-4) 11, 109 variantes, de las cuales 7,113 (64%) han sido descritas como polimorfismos (SNP) de acuerdo al algortimo conservativo HCDiff. Con relación a la distribución de estas variantes, los cromosomas 10 y 2 fueron los más afectados. Las nuevas variantes somáticas encontradas serán confirmadas por secuenciación convencional. El análisis de los pacientes remanentes está en avance. Mediante el empleo de esta medotología de nueva generación, nosotros contribuiremos en identificar nuevos marcadores o alvos terapéuticos así como ayudar a completar el catálogo de las variantes somáticas recurrentes y hereditarias asociadas con el desarrollo de BLBC.